أنشئت وكالة الجامعة بموجب الموافقة السامية من لدن خـادم الحرميـن الشريفيـن المـلك عبداللـه بـن عبدالعزيز آل سعود - رحمه الله - رئيس مجلس التعليم العالي بجلسته التاسعة والخمسين. وبذلك تسعى وكالة الجامعة لتطوير النظام الإداري والمالي في الجامعة ويشرف على النظام الإداري والمالي بالجامعة أكاديميون وإداريون متميزون لتقديم خدماتهم الإدارية والمالية لجميع منسوبي الجامعة وتعتبر الوكالة عصب حيوي مهم يبني خطط الجامعة التطويرية والإدارية والمالية ويتابع تنفيذها. وتقوم الوكالة بالإشراف على العمادات والإدارات المساندة لها، وتقوم بإعداد البرامج والخطط الخاصة بتطوير العمل الإداري والمالي والفني وتنفيذ برامج ومشاريع ميزانية الجامعة.